تأسس الفرع عام 1987 المهام التي يقوم بها الفرع :
يشرف الفرع على مجموعة من المقررات السريرية والنظرية لطلبة الدراسات الاولية بدءاً من المرحلة الثالثة وحتى السادسة.
ويتألف الفرع من التفرعات التالية :
الجراحة العامة
الكسور والمفاصل
الجراحة البولية
الاشعة التشخيصية
جراحة الجملة العصبية
جراحة الصدر والاوعية الدموية
جراحة العيون
جراحة الانف والاذن والحنجرة
الجراحة التجميلية والحروق
التخدير والعناية المركزة
جراحة الاطفال